《女神异闻录 圣洁之魂》是一部基于经典游戏《女神异闻录3》世界观衍生的原创电视动画。故事舞台设定在近未来的绫风市，这座城市正从一场导致大量居民陷入无气力状态的灾难中逐渐复苏。主人公神乡慎与弟弟洵返回故乡，与身为警察署长的长兄谅重逢。然而，看似平静的日常生活被接连发生的离奇事件打破。这座城市夜晚会出现神秘的“影时间”，普通人对此毫无知觉，而慎却发现自己拥有在此时间活动的能力。随着调查深入，慎结识了同样能进入影时间的同伴，他们必须运用被称为“Persona”的内心之力，与侵袭现实的阴影怪物战斗。故事核心围绕神乡三兄弟展开，探讨了家庭羁绊、记忆创伤以及对自我身份的追寻。动画在保留《女神异闻录》系列标志性元素——如人格面具召唤、影时间设定和深刻心理描写的同时，构建了一个独立而完整的故事线，展现了角色们在光明与阴影交织的世界中，为守护重要之物而战的历程。