《蜂蜜与四叶草》第一季以东京一所美术大学为舞台，围绕竹本祐太、真山巧、森田忍三位同居男生的日常生活展开。竹本是个性格温和却略显笨拙的建筑系学生，在遇到天才少女花本叶久美（阿久）后，初次体会到了暗恋的甜蜜与苦涩。真山则默默爱慕着年轻的女设计师原田理花，而森田虽看似古怪不羁，实则是拥有惊人艺术天赋的“留级天才”。故事随着花本老师将表侄女阿久带入这个小圈子而徐徐展开。阿久虽外表如孩童般娇小，却拥有震撼人心的绘画才能，她的出现悄然改变了众人的关系。竹本对阿久一见钟情，却因自卑而不敢表白；森田以他特有的方式关心着阿久；真山则在理花与一直爱慕他的山田亚由美之间徘徊。作品细腻刻画了这群年轻人在追求艺术梦想过程中的迷茫、成长与情感纠葛，用清新笔触描绘了那段夹杂着欢笑与泪水的青春岁月。